Настольные сканеры, как следует из названия не держат в руках. Они устанавливаются на столе или встраиваиваются в поверхность стола. Для считывания штрихового кода товар подносится к окну считывания сканера.
К настольным относятся также презентационные сканеры, которые могут использоваться в режиме ручного проводного сканера.